Legatura peptidica are doua forme de rezonanta care contribuie la un caracter de dubla legatura si inhiba rotatia in jurul axei sale, astfel incat carbonii alfa sunt aproximativ coplanari. Celelalte doua unghiuri diedrice din legatura peptidica determina forma locala asumata de coloana vertebrala a proteinei. Capatul cu o grupare amino libera este cunoscut ca capatul N-terminal sau capatul amino terminal, in timp ce capatul proteinei cu o grupare carboxil libera este cunoscut ca capatul C-terminal sau capatul carboxi terminal (secventa proteinei se scrie de la N-terminal la C-terminal, de la stanga la dreapta). Pentru un surplus de proteine recomandam cereale Bio Milzu Crunchies cu Secara si Cacao.
Cuvintele proteina, polipeptida si peptida sunt putin ambigue si se pot suprapune in sens. Proteina este in general utilizata pentru a se referi la molecula biologica completa intr-o conformatie stabila, in timp ce peptida este in general rezervata pentru oligomerii de aminoacizi scurti, adesea lipsiti de o structura 3D stabila. Dar granita dintre cele doua nu este bine definita si se afla de obicei aproape de 20-30 de reziduuri. Polipeptida se poate referi la orice lant liniar unic de aminoacizi, de obicei indiferent de lungime, dar adesea implica absenta unei conformatii definite.
Interactiuni
Proteinele pot interactiona cu multe tipuri de molecule, inclusiv cu alte proteine, cu lipide, cu carbohidrati si cu ADN.
Abundenta in celule
S-a estimat ca bacteriile de dimensiuni medii contin aproximativ 2 milioane de proteine per celula (de exemplu, E. coli si Staphylococcus aureus). Bacteriile mai mici, cum ar fi Mycoplasma sau spirochetele contin mai putine molecule, de ordinul a 50.000 pana la 1 milion. In schimb, celulele eucariote sunt mai mari si, prin urmare, contin mult mai multe proteine. De exemplu, s-a estimat ca celulele de drojdie contin aproximativ 50 de milioane de proteine si celule umane de ordinul 1 pana la 3 miliarde. Concentratia de copii individuale de proteine variaza de la cateva molecule per celula pana la 20 de milioane. Nu toate genele care codifica proteine sunt exprimate in majoritatea celulelor si numarul lor depinde, de exemplu, de tipul celulei si de stimulii externi. De exemplu, din cele aproximativ 20.000 de proteine codificate de genomul uman, doar 6.000 sunt detectate in celulele limfoblastoide.
Sinteza
Proteinele sunt asamblate din aminoacizi folosind informatii codificate in gene. Fiecare proteina are propria sa secventa unica de aminoacizi, care este specificata de secventa de nucleotide a genei care codifica aceasta proteina. Codul genetic este un set de seturi de trei nucleotide numite codoni si fiecare combinatie de trei nucleotide desemneaza un aminoacid, de exemplu AUG (adenina – uracil – guanina) este codul pentru metionina.
Deoarece ADN-ul contine patru nucleotide, numarul total de codoni posibili este de 64; prin urmare, exista o oarecare redundanta in codul genetic, cu unii aminoacizi specificati de mai mult de un codon.
Genele codificate in ADN sunt mai intai transcrise in ARN premesager (ARNm) de proteine precum ARN polimeraza. Cele mai multe organisme proceseaza apoi pre-ARNm (cunoscut si ca transcript primar) folosind diferite forme de modificare post-transcriptionala pentru a forma ARNm matur, care este apoi folosit ca sablon pentru sinteza proteinelor de catre ribozom. La procariote, ARNm poate fi fie utilizat imediat ce este produs, fie legat de un ribozom dupa ce s-a indepartat de nucleoid. In schimb, eucariotele produc ARNm in nucleul celulei si apoi se translocatraverseaza membrana nucleara in citoplasma, unde are loc apoi sinteza proteinelor. Rata de sinteza a proteinelor este mai mare la procariote decat la eucariote si poate ajunge pana la 20 de aminoacizi pe secunda.
